Auf einem kleinen Bauernhof irgendwo im ländlichen England lebt Shaun das Schaf. Shaun unterscheidet sich von den übrigen Schafen nicht nur durch seinen unverwechselbaren Wuschelkopf und das modisch kurze Fell: Er ist auch das unternehmungslustigste und intelligenteste Schaf weit und breit und somit der natürliche Anführer seiner Herde.

So ist Shaun stets zur Stelle, wenn es auf dem Hof ein Problem zu lösen gilt. Weil Shaun jedoch noch jung und unerfahren ist, sorgt er bei seinen Aktionen unabsichtlich immer wieder für Chaos. Besonders Hütehund Bitzer, der mit der Aufsicht über die Schafe betraut ist, sieht das gar nicht gerne. Schließlich soll der etwas naive Bauer auf keinen Fall erfahren, was das liebe Vieh hinter seinem Rücken so alles anstellt…

Auch in der zweiten Staffel besticht Jungschaf Shaun durch seine unnachahmlichen Ideen und Führungsqualitäten. Da können alle Störenfriede der ländlichen Idylle - wie der verfressene Fuchs, eine nervige Elster, ein humorloser Landwirtschaftsinspektir, die frechen Schweine und Stubentiger Pidsley - ganz schnell einpacken, denn Shauns Einfallsreichtum ist völlig unberechenbar. Hütehund Bitzer, der so gerne eine ruhige Kugel schieben würde, ist deshalb oft hin- und hergerissen zwischen Dankbarkeit für Shauns Eingreifen und dem blanken Horror, dass der Bauer eines Tages doch noch erfährt, was hinter seinem Rücken so alles geschieht.